bbsunchen
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最新评论
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hanmiao：
CSDN 博客地址是这個？http://blog.csdn.n ...
将博客搬至CSDN -
chenwq：
下载了，谢谢分享！
R语言学习入门 -
bbsunchen：
今天跟英姐聊天，她verbal考了151，不够啊，数学也不高。 ...
跟我一起考GRE（三） -
bbsunchen：
qinger说得对我今年只做三件事情：考好GRE，考好TOEF ...
IT行业成功必备的素质 -
bbsunchen：
还有8天就考试了，哥还在过单词啊
跟我一起考GRE（三）
文章列表
积极心理学与创新
- 博客分类：
- Brain Storm
最近一直在看网易开放课程的《幸福课》，英文是positive psychology，积极心理学。翻译成《幸福课》严重有损这门课的学术价值和巨大作用。这门课的价值就在于，教授的理论都是我们知道的，可是他会很明确地告诉你，我们知道的理论，哪些是实验验证的，哪些是dispute的，哪些是disprove的。
比如，对着镜子说“我很棒，我很成功，我很帅”，这一点都不会增加自己的自信心，反而，长时间这么做会对心理产生严重的负面影响。
向iteye的程序员们隆重推荐这门课程（非广告），我看到第11课了，不得不说认真地听讲还是蛮痛苦的过程，可是收获甚多。
顺便说一下前面5课是基础知识， ...
荣耀归于上帝，版权归于bbsunchen。本文部分翻译自Bioinformatics.For.Dummies的第14章，加入作者经验，改动较大，不喜误入。
本文讨论的主要问题：
1.确保你不会泄漏保密的数据
2.保证你自己可以重复你的工作
3.选择合适 ...
跟我一起考GRE（三）
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- 留学
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更新下，我GRE后来考了 157+165+3，所以下面的经验还是有点用的
TOEFL 101
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这次我想重点谈谈背单词。
GRE单词。
怎样背GRE单词。
就是要找不同的环境去认识这个单词。
我推荐的几个环境：
1.赵丽的GRE红宝讲解。
2.刘一男的GRE单词讲解。
3.再要你命三千。
4.老罗的填空，做题记单词。
5.杨子江的填空。
考GRE就是重复重复再 ...
如何保持开放的头脑
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- bioinformatics
世界向我打开一扇大门，我却选择转过身，背对这个世界。
这句话用在我身上再合适不过，在中科院的两年时间，我的面前是浩如瀚海的生命科学的世界，可是我却受到各种各样的声音的干扰，认为做生物方向没有前途，仍然搞技术，每天痴迷于学习各种各样的IT新技术。
可是，现在我真的觉得自己在生命科学中，能够做很多事情。
也许，我只是没有open mind，可是我还很年轻啊，为什么会这样呢？
人生有两大悲剧，一是万念俱灰，另一是踌躇满志。
我觉得我先上演了第一出，接下来又要上演第二出了...
不过，我现在的目标倒是渐渐清晰，希望用接下来十年的时 ...
Homologs which originate following gene duplications are called paralogs, a term in biology
often mistakenly thought to apply to homologs within a genome.
Paralogy can exist between genes in different species, since gene duplication events occur
both before and after speciation.
...
从第一个项目canto（有兴趣的可以到google code上看看，这是bbsunchen的第一个大型项目）到现在在中科院的项目，只要是事关发布的，我一直使用google code和svn来做版本控制工作。而Sourceforge，则是在最近要发表论文时才发现， ...
网上有很多说非root权限怎么安装perl模块的帖子，我觉得说的都不到位
linux系统已经自带了perl,但是如果需要某一个模块的时候，可以单独安装模块
如果你有root权限，你可以使用CANP，如果你没有root权限，那么bbsunchen教你使用如下方式1. 安装模块
进入模块所在路径，就是你的模块放在哪里，你就cd进去，然后执行下面的命令...perl Makefile.PL PREFIX=/home/sunch/biosoft/perlmake;make test;make install
注意PREFI的格式，必须要写成这几个字，前面不能加-或 ...
在使用Linux或是unix时，perl是一个非常有用的脚本的语言。
关于perl的模块安装，网上也有很多介绍，一方面可以通过不同套件自带的软件安装工具安装，一方面可以通过cpan安装，再者就是可以直接编译源代码。
这样， ...
1. 运行iprscan的时候，一般需要根据机器的能力和安装interproscan时设置的chunk大小，将序列文件切成若干小文件，这些小文件，每个文件包含1-2个chunk大小序列条数的文件。
这个时候，有可能原始文件也放在切后的文件夹中忘记删除。
2.我现在挺怀疑interproscan在书写过程总，对软连接的容错能力的。因为我在两台大型机中都有软连接的存在，在这两台机器上运行都会莫名其妙地报错。而现在在新的大型机上，没有软连接存在，现在依然能够正确运行。有兴趣的可以实验一下。
interproscan的安装和运行，很多网站都有介绍，这里主要介绍下我做的性能测试。
今天bbsunchen做了interproscan性能测试，具体数据不能公布，结果大致如下：
1.interproscan运行时，蛋白质平均长度对运行时间影响不大。
蛋白质平均长度是30aa和蛋白质平均长度是300aa时，运行效率都大致维持在100条序列/小时
2.是否进行crc64计算对运行时间影响不大。不进行crc64运算，30aa平均长度，100条序列节省的时间大概在2分钟左右。
3.用全部数据库参与比对比不用全部数据库，运行时间消耗高一倍。
4.用7个数据库和 ...
下班了，想起来有几个问题上一集没有讲到，这里谈一下。 如果你连十块钱都没有，或者抢不到10块钱的课。那我建议你到太傻和寄托论坛上，去下载别人上传的新东方网络课堂，一定，创造条件把这个网络课堂看完。 并且，要到太傻或者寄托论坛上，去战友帖里面搜几个扣扣群，加进去，大家都很慷慨。（这个建议是黄妍老师给的）我的好多资料，都是这个群里的人给的。有问题，可以浏览论坛，可以到群里问。没见过哪个群，互相帮助的程度是这个样子的，一定要问。
现在开始整填空部分了，填空据说杨子江说的很好，他还特意总结了关于填空的所有词汇，很多很多，这是网址http://blog.sina.com.cn/ ...
准备GRE快一年多了，这期间断断续续，走了不少弯路，感觉自己渐渐有点上道了。先在自己的blog中将自己的感悟写下来。以备如果真的成功了，将来可以发到论坛上，跟大家分享，如果失败了，也权当日记和回忆了。
首先说，为啥准备了一年多，这全都在背单词。可是到最后单词背了多少呢？只背了A，对，你没有听错，只背了A，B-Z的单词全都不认识。
然后我从11年11月1日，突然开始想要认真准备了。也就是说，到写这篇日志，我准备了一个多月了。之前一年多已知看不下去书，为什么？因为我不确定要不要出国，因为我觉得时间还早着呢。这之间，我看了杨鹏长难句，和北美作文大讲堂里，关于Argument和I ...
先说PAML中文文档，PAML是杨子恒院士写的软件，这个中文文档是bbsunchen根据网络资源整理的详细文档。有PAML使用的详细步骤。
再说说计算分子进化，杨子恒大大N年磨一剑的书，计算的算法、理论的意义、生物的背景都叙述得 ...
为什么要做这次文字的介绍，因为在一般的教材中，还真没有文字的描述：
1.绘制最简单的文字。
我们更改重绘函数如下：
void Dialog::paintEvent(QPaintEvent *){QPainter painter(this);painter.drawText(100,100,”yafeilinux”);}
我们在（100，100）的位置显示了一行文字，效果如下。
2.为了更好的控制字体的位置。我们使用另一个构造函数。在帮助里查看drawText，如下。
这里我们看到了构造函数的原型和例子。其中的flags参数可以控制字体在矩形中的位置。我们更改函数 ...