关于j2ee web开发的一些疑问

   最近看了一些关于开发方法的知识，但没有在实际项目中运用过。有很多的疑问，希望大家能帮忙指点一下啊。
    我是搞j2ee web开发的，一直很迷茫的就是开发时，这个持久层是在什么时候去做的啊，是一开始就搞好呢，还是也会循序渐进的去做啊。我们以前一直的做法是是需求分析完了，然后在建立实体关系，由此建立实体关系，在建立类似的持久层什么的，基本上是一次搞好。不过感觉这个是不是类似瀑布开发啊。这样的话一般是事先把能想到的用例都要想到的，然后才能保证实体关系建立得比较完整，基本不用在改动了。
    我想问一下，如果敏捷开发的话，是不是这种实体关系也是在不断的完善的，即不是在开发前一次就建好的，是慢慢的不断的在变化、增加的，那如果是这样的话，那就意味着实体关系在不断的扩展，持久层也会在变化、扩展，数据库结构也会有所变化啊。
可能理解的不对，不过希望大家能指点一下敏捷中如何处理实体关系，持久层的，因为感觉很多书上都没仔细的指出这个，或者大家能推荐一下基本将这方面的书也行啊，谢谢！