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后缀树(Suffix Tree)

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1,后缀树(Suffix tree)是一种数据结构,能快速解决很多关于字符串的问题。后缀树提出的目的是用来支持有效的字符串匹配和查询。
简单点说,后缀树就是将一个给定字符串的所有后缀全部压入一个Trie,然后将只有单个叶子的节点压缩,从而形成的一棵树.

2,后缀树的用途,总结起来大概有如下几种
(1). 查找字符串o是否在字符串S中。
方案:用S构造后缀树,按在trie中搜索字串的方法搜索o即可。
原理:若o在S中,则o必然是S的某个后缀的前缀。
例如S: leconte,查找o: con是否在S中,则o(con)必然是S(leconte)的后缀之一conte的前缀.有了这个前提,采用trie搜索的方法就不难理解了。
(2). 指定字符串T在字符串S中的重复次数。
方案:用S+’$'构造后缀树,搜索T节点下的叶节点数目即为重复次数
原理:如果T在S中重复了两次,则S应有两个后缀以T为前缀,重复次数就自然统计出来了。
(3). 字符串S中的最长重复子串
方案:原理同2,具体做法就是找到最深的非叶节点。
这个深是指从root所经历过的字符个数,最深非叶节点所经历的字符串起来就是最长重复子串。
为什么要非叶节点呢?因为既然是要重复,当然叶节点个数要>=2。
(4). 两个字符串S1,S2的最长公共部分
方案:将S1#S2$作为字符串压入后缀树,找到最深的非叶节点,且该节点的叶节点既有#也有$(无#)。

3,后缀树的构造:O(n)
给定一个txt:`mississippi'
(1)得到txt的所有后缀:
T1  = mississippi = txt
T2  = ississippi
T3  = ssissippi
T4  = sissippi
T5  = issippi
T6  = ssippi
T7  = sippi
T8  = ippi
T9  = ppi
T10 = pi
T11 = i
T12 =               (empty)
(2)将所有非空后缀进行排序,得到:
T11 = i
T8  = ippi
T5  = issippi
T2  = ississippi
T1  = mississippi
T10 = pi
T9  = ppi
T7  = sippi
T4  = sissippi
T6  = ssippi
T3  = ssissippi
(3)将所有后缀的公有前缀进行合并,即可得到:

           tree                       substrings

tree-->|---mississippi                m .. mississippi
       |
       |---i-->|---ssi-->|---ssippi   i .. ississippi
       |       |         |
       |       |         |---ppi      issip,issipp,issippi
       |       |
       |       |---ppi                ip, ipp, ippi
       |
       |---s-->|---si-->|---ssippi    s .. ssissippi
       |       |        |
       |       |        |---ppi       ssip, ssipp, ssippi
       |       |
       |       |---i-->|---ssippi     si .. sissippi
       |               |
       |               |---ppi        sip, sipp, sippi
       |
       |---p-->|---pi                 p, pp, ppi
               |
               |---i                  p, pi

--- Suffix Tree for "mississippi" ---

4,应用

问题:
寻找字符串S的最长回文字符串.
注:所谓“回文”是指当一个字符串正序读和逆序读时都一样。即p=reverse(p)

分析:
等价于寻找S与reverse(S)的最长公共部分.
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