wwwblast apache彻底解决方案

本地搭建自己的NCBI胺基酸序列BLAST比对网站

1、到ncbi下载wwwblast，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/download.shtml

然后解压到apache www服务器的默认目录,gentoo的默认目录是/var/www/localhost/htdocs/。

2、修改/etc/apache2/httpd.conf，加入下列代码

<Directory "/var/www/localhost/htdocs/blast">
AddHandler cgi-script cgi REAL
Options Indexes FollowSymLinks MultiViews +ExecCGI
Order allow,deny
Allow from all
</Directory>

<Directory "/var/www/localhost/htdocs/blast">
AllowOverride None
Options +ExecCGI
Order allow,deny
Allow from all
</Directory>

3、重启apache2

/etc/init.d/apache2 restart

4、格式化数据库文件,我们已在ncbi下载vector载体数据库为例，具体用法请参见

formatdb的说明
formatdb -i vector -p F -o T -n vector

5、修改blast.rc和blast.html文件
（1）blast.rc
在blastn后面加入vector
（2）blast.html
在<select name = "DATALIB">选项后添加
<option VALUE = "vector"> vector

6、更改目录权限
进入blast的安装目录
chmod 775 *
chmod 777 TmpGifs
chmod 666 *.log

7、进入http://ip/blast进行blast了

 

以上为通用方法，但还是会出现错误403，

那就得按以下的方法解决一下

顺便问了两句，原来这个机器开了selinux，可能是它造成的，试试关闭selinux对apache的保护：

/usr/sbin/setsebool -P httpd_disable_trans 1