EST的由来

EST(Expressed Sequence Tag)表达序列标签：是指从不同组织来源的cDNA序列
EST技术直接起源于人类基因组计划。由于人类基因数量巨大，以及真核基因特有的复杂性（如内含子、外显子的区别、重复序列等），使得一次性不加选择地对基因组全长进行测序成为几乎不可能完成的工作。Venter等人在1991年提出了表达序列标签（EST）技术。

EST的原理：
EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。EST 来源于一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。

 

EST数据库并非完美无瑕，因为ESTs不能被剪切为单列序列位点识读，故精确度只能达到97%，另外，ESTS受制于表达倾向（expression bias），因为产生ESTs的cDNA是组织中丰富的mRNA以一定比例反转录而成，因此，表达水平很低的EST数据库中找到，而表达量高的基因在EST数据库中却过量存在。虽然可在起始mRNA或由它合成双链cDNA时进行富集，减小cDNA文库，但cDNA文库中仍存在大量高丰度的cDNA克隆。因此，一个理想的cDNA文库必须去除或尽量消除多科信息克隆的影响，这就涉及到cDNA文库的前加工技术；均等化（normalization），减少与丰富编码基因相关的cDNA数目；消减杂交（subtractive hybridization），应用序列标记cDNA识别并去除文库中多余的克降，这些技术的发展，使基因识别更依赖于EST技术，甚至可通过该技术获得精确的基因组DNA序列，在华盛顿大学基因组测序中心和Sanger中心的联合攻关下，C.elegans基因组10亿个碱基对的测序工作基本完成。因此ESTs是一系列基因寻找工具中不可缺少后部分，而这些工具都是基因组序列为基础的。EST技术关于基因组DNA序列的其他应用还包括对基因内含子、外是子排列的精确预测，选择性接合事件的识别，反常基因组排列结构的识别等。


ESTs中的s代表来源于同一cDNA的不同克隆群。

简单些的描述：我们可以对猪EST数据库进行筛选,获得高度同源的猪ESTs，构建EST重叠群...............

 

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