eclipse中每次保存修改过的java文件，它都会重新编译，编译后的文件就放在build path里的Output folder。或者是xml文件.properties文件等都会将新内容放到输出文件夹。而build path的libraries中的jar包是保证这些类的成功编译。
然后将项目发布在server上，eclipse会从deplyment assembly中获取要发布的内容，当然发布不需要源码，只需要class文件，这些class文件就是从上面放置编译好的class文件的输出文件夹寻找。比如deployment assembly中将src/main/java中的类及配置文件发布到WEB-INF/classes下，那去哪里找这些class文件呢？就是在build path中看到test/src/main/java的输出文件夹是/test/target/classes，那就会到计算机上项目路径寻找项目src/main/java目录下的java文件对应的class文件并放入到WEB-INF/classes中（target/classes在eclipse的Project Explorer中可能看不见在计算机项目目录中能看到）。
server右键中有个clean的选项，它的作用是将发布到eclipse自己的webapps目录（一般自动命名为wtpwebapps）中的项目删掉重新从output folder中拉取。比如我把target/classes中的一个编译好的class文件删除掉，当然这时候java文件还是在的，那我clean一下项目，就会报如下错误。
clean tomcat work directory的作用则是将已发布项目中存放jsp转译后的class文件的work目录删除
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