字串 london 經過 BWT 會得到2 個資訊(nnoold 與 index=1),而由這2個資訊可以再還原回原始資訊 london
---
<rots>
london
ondonl
ndonlo
donlon
onlond
nlondo
<sort>
F L
donlon
london <
ndonlo
nlondo
ondonl
onlond
得到2個資訊 nnoold 與 index=1
============================
還原 (nnoold 與 index=1)
<sort>
dlnnoo
d n < n的下一個字元為d
l n < n的下一個字元為l <--index=1n o < o的下一個字元為n
n o < o的下一個字元為n
o l < l的下一個字元為o
o d < d的下一個字元為o
step1:l的下一個字元為o
lo n
step2:o的下一個字元為n
lon n
step3:n的下一個字元為d
lond n
step4:d的下一個字元為o
london <--得到還原後的資訊
相關連結:
(Research Blog of 穆信成 Shin-Cheng Mu)Inverting the Burrows-Wheeler transform(Mark Nelson Programming, mostly.)Data Compression with the Burrows-Wheeler Transform(wiki)Burrows-Wheeler transform
分享到:
相关推荐
### 布罗沃斯-惠勒变换 (Burrows-Wheeler Transform, BWT):数据压缩、后缀数组与模式匹配 #### 引言 布罗沃斯-惠勒变换(Burrows-Wheeler Transform,简称BWT)是数据压缩领域的一个重要技术,它不仅在提高数据...
Burrows-Wheeler Transform and FM Index Ben LangmeadYou are free to use these slides. If you do, please sign the guestbook (www.langmead-lab.org/teaching-materials), or email me (ben.langmead@gmail....
burrows-wheeler-transform概述・在 c 中的 burrows-wheeler-transform・在 c 中移到前面描述用法burrows-wheeler-transform $ ./bwt -hOptions: -t : Burrows-Wheeler Transform. Input File. -i : Inverse Burrows...
Burrows-Wheeler_Transform 字符串字符的可逆排列,可用于基于块排序的无损数据压缩。 作者: Levindo Gabriel Taschetto Neto 如何使用 python main.py string$ 执照 MIT许可证。 单击以获取有关此许可证的更多...
标题"BWT.rar_C++_bwt_compress_in"指的是使用C++实现的Burrows-Wheeler Transform(伯罗斯-怀勒变换,简称BWT)压缩算法。这个压缩算法是数据压缩领域的一个重要技术,由Michael Burrows和David Wheeler在1994年...
Burrows-Wheeler转换实现这是的Java实现。 该实现遵循视频中给出的描述。 编码和解码逻辑要求EOF字符,该字符必须是输入中用于编码的最后一个字符,以使其值小于输入中所有其他字符。 “最小”字符\u0000是一个不错...
在IT领域,特别是数据处理和文本分析中,Burrows-Wheeler变换(Burrows-Wheeler Transform,简称BWT)是一种非常重要的预处理技术。它由Michael Burrows和David Wheeler在1994年提出,主要用于数据压缩和生物信息学...
介于两者之间:BWT 和退出Python 实现,用于我的演讲, .用法: betwixt.py --test or -t # run testsbetwixt.py --repl or -r # encode and decode inputbetwixt.py --verbose or -v # show intermediate steps
【标题】"b.m.rar_b-m算法"是一个与Matlab编程相关的压缩文件,其中包含了对B-M算法(可能指的是Burrows-Wheeler Transform,一种文本压缩算法)的实现和应用。这个压缩包提供了三个源代码文件(b1.m、b2.m、b3.m)...
1. **bwtcoder.c** - 这个文件名中的 "bwt" 可能代表 Burrows-Wheeler 转换(Burrows-Wheeler Transform),这是一种预处理技术,常用于数据压缩。它通过重新排列输入字符串的字符顺序来优化后续的压缩过程。在...
字符串压缩通常基于特定的算法,如霍夫曼编码、LZ77、LZ78、Run-Length Encoding (RLE) 或者Burrows-Wheeler Transform (BWT)。这些算法的目标是减少字符串的存储空间,通过识别和利用字符串中的重复模式或统计特性...
标题 "BWT.rar" 包含的是一个关于MATLAB实现的BWT(Burrows-Wheeler Transform)压缩算法,结合了算术编码器(Arithmetic Codec),用于高效地压缩文本数据。这一组合提供了高效的文件压缩解决方案,特别是在处理...
标题中的“dwt.rar_bwt”可能指的是使用Burrows-Wheeler Transform(BWT)算法进行数据处理的一个压缩包文件,其中可能包含了相关的代码或程序。BWT是一种文本压缩算法,它通过对输入序列进行重新排序来提高压缩效率...
这个主题涉及到的是使用MATLAB进行B编码(Burrows-Wheeler Transform,简称BWT)的编码器和解码器的开发。B编码是一种数据预处理技术,常用于文本压缩和生物信息学领域。它通过重新排列输入序列的字符来改变其结构,...
标题和描述中提到的文件似乎是一个Python编程作业的一部分,涉及到字符串操作和生物信息学中的Burrows-Wheeler Transform(BWT)算法。虽然标签没有提供具体的信息,但从内容来看,我们可以推断出以下IT知识点: 1....
1. **Burrows-Wheeler Transform (BWT)**:这是一种文本预处理技术,通过旋转矩阵和排序字符来创建一个新的排列,使得具有相同后缀的字符串相邻。BWT能够减少查找过程中需要考虑的候选匹配,从而加速比对过程。 2. ...
为了解决这些问题,有多种算法被开发,如哈希表、动态规划和Burrows-Wheeler Transform (BWT)。BWT是一种高效的预处理方法,可以用来构建Burrows-Wheeler矩阵,并通过Last-First (LF) mapping实现快速定位。 3. **...
压缩技术包含了多种技术,包括Run-Length Encoding、Burrows-Wheeler Transform、Entropy Encoding、Shannon-Fano Coding、Huffman Coding、Arithmetic Coding等。这些技术可以单独使用,也可以组合使用以达到更高的...
Burrows-Wheeler Transform(BWT)是另一种高效的映射方法,它可以快速处理数据,但在处理空隙和错配时可能不够敏感。 总的来说,二代测序数据分析是一个涉及多个步骤的复杂过程,包括数据预处理、序列映射、基因型...