生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年,著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图,可见3D技术在很多领域都是发展方向。
使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型,效果如下:
当然简单的呈现DNA分子结构,仅仅是一部分功能,如果将mono和专业的DNA分析仪结合,不仅可以发现病症,更重要的是预测病症的发生,治病于未发,这将是人类的福音。除了研究人类基因之外,我们还可以对农作物的进行DNA3D模型化,并加以分析,对农业的发展和粮食安全方面都会有积极的意义。
使用mono创建3D模型最大的特点就是快,代码不过几十行,使用Editor更是不需要代码量。本文的效果图通过代码实现,核心代码如下:
1 |
function createDNA(box, x, y, z, colors){ |
2 |
var count= 20 +Math.random()* 50 ;
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4 |
var parent=createNode(box, 10 , 0 , 0 , 0 , 'red' );
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5 |
for (var i= 0 ;i<count;i++){
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6 |
var angle=Math.PI* 2 / 360 * 15 *i;
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7 |
var radius = (i % 2 == 0 ) ? 10 : 7 ;
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8 |
var color = colors[i% 2 ]
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9 |
var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color);
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10 |
var node2=createPairNode(box, dist* 0.3 , radius, i, angle, color);
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11 |
node1.setParent(parent);
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12 |
node2.setParent(parent);
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15 |
var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, 'gray' );
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16 |
var node3=createPairNode(box, dist* 0.58 , radius* 0.4 , i, angle, 'cyan' );
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17 |
var node4=createPairNode(box, dist* 0.72 , radius* 0.4 , i, angle, 'cyan' );
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18 |
link.setParent(parent);
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19 |
node3.setParent(parent);
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20 |
node4.setParent(parent);
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23 |
parent.setPosition(x,y,z);
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24 |
parent.setStyle( 'm.visible' , false );
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1 |
function createPairNode(box, size, radius, index, angle, color){ |
2 |
var x=size*Math.sin(angle);
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3 |
var z=size*Math.cos(angle);
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5 |
var node = createNode(box, radius, x, y, z, color);
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